Temporada 7
November 7, 1999
El inspector del FBI, Fox Mulder, se encuentra ingresado en una unidad de cuidados psiológicos, padeciendo unos extraños impulsos eléctricos. Dana Scully, mientras tanto, lucha por descifrar unos extraños símbolos que han aparecido en una nave espacial sumergida en plena Costa de Marfil. Scully debe darse prisa, pues los símbolos contienen la clave para solucionar el problema que Mulder padece y son la única forma de salvar al mismo. En esta temporada, los investigadores deberán luchar a contrarreloj contra un fenómeno que, cada vez, es más real.
22 Episodios
Episodios
La sexta extinción I
November 7, 1999
Mientras Scully viaja a África para poder descifrar el significado de los símbolos de una nave enterrada en una playa de Costa de Marfil, Mulder padece de una frenética actividad cerebral. Logra darle un mensaje a Skinner quien encuentra a Kritschgau y juntos tratan de entender qué le sucede a Mulder antes de que sea demasiado tarde.
La sexta extinción II: Amor Fati
November 14, 1999
Scully busca desesperadamente la manera de ayudar a su enfermo compañero sin tener nadie a quien recurrir, mientras los sueños de un Mulder catatónico le llevan lejos de los Expedientes X, donde cree encontrar una vida mejor.
Hambriento
November 21, 1999
Mulder y Scully llegan a un restaurante para investigar el asesinato en el que el criminal había absorbido el cerebro de la víctima a través de un agujero en el cráneo. No tardarán en encontrarse con Rob Roberts, el principal sospechoso.
Milenio
November 28, 1999
Skinner le habla a Mulder y Scully del ouroboro, la serpiente que se muerde la cola del Grupo Millennium, antiguos agentes del FBI que ya no trabajan allí. Las pistas le conducrirán a Frank Black, un agente que les introducirá en una siniestra investigación relacionada con el final del milenio, necromancia, el final de los tiempos.
Aceleración
December 5, 1999
Scully investiga la muerte de un oficial de policía a manos de un asesino 'invisible' en Pittsfield, Virginia, en un bosque que parece ocultar poderes especiales. Las pesquisas de Mulder y Scully apuntan a dos jóvenes del lugar.
La variante Goldberg
December 12, 1999
Mulder y Scully se quedan atrapados en la teoría de Rube Goldberg cuando conocen a Henry Weems, que quizás sea el hombre más afortunado del mundo, salvo porque los que le rodean no tienen tanta suerte.
Orison
January 9, 2000
El Reverendo Orison espera salvar el alma de Donnie Pfaster ayudándole a escapar de prisión. Su equivocación queda clara cuando Donnie trata de encontrar a su última víctima: Scully.
El asombroso Maleeni
January 16, 2000
Cuando un mago realiza un truco donde parece dar la vuelta a su cabeza y es encontrado decapitado en su camioneta, Mulder y Scully piensan que fue asesinado por un intrincado plan elaborado por otros dos magos para robar un banco.
Señales y milagros
January 23, 2000
Diversos "pecadores" empiezan a ser asesinados por serpientes, pero Mulder y Scully dudan que se trate de un caso de castigo Divino.
Existencia y tiempo
February 6, 2000
Una niña desaparece de su casa y Mulder pide el caso a pesar de no ser un Expediente X. Cuando logra convencer a los padres de la niña de que su hija será encontrada viva, Scully teme que se involucra demasiado debido a la abducción de su hermana.
Conclusión
February 13, 2000
Después de arrestar al asesino de Amber-Lynn LaPierre y descubrir una tumba común con los cadáveres de docenas de niños desaparecidos, un hombre acude a Mulder diciendo tener visiones de otras víctimas que no fueron enterradas allí. A pesar de las objeciones de Scully, lleva a Mulder a un viaje que le revelará lo que le sucedió a su hermana.
Policías X
February 20, 2000
Un oficial de policía de los Los Ángeles que estaba siendo grabado para el programa COPS es atacado por un monstruo y Mulder y Scully investigan el caso. Scully es reacia a aparecer en la televisión nacional pero a Mulder le agrada la publicidad.
El primero que dispare
February 27, 2000
Los Pistoleros Solitarios llaman a Mulder y Scully para que acudan a un laboratorio de desarrollo de realidad virtual cuando descubren que uno de los creadores fue asesinado dentro del videojuego y el único indicio es la imagen de una mujer. Mulder entra al juego para combatir a la mujer pero Scully deberá hacer lo mismo para salvarle.
Ladrón
March 12, 2000
Mulder y Scully sospechan que un brujo sea el responsable de las amenazas a la familia de un médico.
Un amigo
March 19, 2000
El Fumador le ofrece a Scully la cura para todas las enfermedades si viaja con él, pero con una condición: Mulder no debe saber nada.
Quimera
April 2, 2000
Cuando Mulder investiga el caso de un desaparecido y su única pista es un cuervo amenazante, aprende a disfrutar de las comodidades del hogar de un monstruo mientras Scully debe ayudarle en una situación incómoda.
Todas las cosas
April 9, 2000
Una serie de coincidencias llevan a Scully a un hombre casado con quien tuvo un romance en la Facultad de Medicina pero tuvo que dejarlo por su familia.
Marca X
April 16, 2000
Cuando un empleado de Morley Tobacco Co. es asesinado, Mulder sospecha que los insectos encontrados en la escena del crimen estaban en sus pulmones y que entraron a través del humo de los cigarillos.
El director de Hollywood
April 30, 2000
Mulder y Scully acuden al estreno de una película donde son los protagonistas y acaban disgustados por el resultado. Recuerdan como 18 meses antes fueron acompañados por un productor de Hollywood mientras investigaban un caso relacionado con "La Vasija de Lázaro", una vasija bíblica en la que parecen estar grabadas las palabras que dijo Jesucristo al resucitar a Lázaro.
El club de lucha
May 7, 2000
Mulder y Scully se cruzan en el camino de dos mujeres idénticas que se han perseguido por 17 de los Estados Unidos durante tres años causando caos y destrucción a su paso.
Yo deseo
May 14, 2000
Mulder y Scully descrubren una genio que, después de 500 años de conceder deseos, llega a la conclusión de que la humanidad no ha mejorado en vanidad y egoísmo como siempre y sabotea los deseos que concede si no son suficientemente "específicos".
Réquiem
May 21, 2000
Mulder y Scully regresan al lugar de su primer caso en los Expedientes X para investigar una nave que se estrelló en el bosque. El Fumador arregla todo para que Alex Krycek salga de prisión y pueda ponerse en contacto con los extraterrestres y reconstruir "El Proyecto".