Jaksot
Alku
November 8, 1998
Mulder ja Scully saavat jatkaa työtään vain siinä tapauksessa, että pystyvät esittämään tutkimuslautakunnalle todisteita maapallon ulkopuolisen elämän olemassaolosta.
Aja!
November 15, 1998
Kohti länttä pyrkivä vakavasti sairas mies pakottaa Mulderin autonkuljettajakseen, sen jälkeen kun hänen vaimonsa on menehtynyt järkyttävällä tavalla.
Paholaisen kolmio
November 22, 1998
Vihollissotilaiden vangiksi joutunut Mulder viedään loistoristelijälle, jossa hän kertoo ällistyneelle kuulijakunnalle, että toinen maailmansota on päättynyt.
Unimaa, osa 1
November 29, 1998
Nevadan autiomaan yli pyyhkäisevä lentävä lautanen aiheuttaa uskomattoman muutoksen alueella vierailevassa Mulderissa ja eräässä paikkakunnalla pysyvästi asuvassa virkamiehessä.
Unimaa, osa 2
December 6, 1998
Mulder yrittää sopeutua perhe-elämään Nevadan autiomaassa, samalla kun hänen hahmossaan esiintyvä Morris Fletcher ottaa Scullyn suureksi hämmästykseksi kaiken irti poikamiespäivistään.
Kuinka aaveet varastivat joulun
December 13, 1998
Mulder ja Scully vierailevat jouluaattona vanhassa talossa, jolla on synkkä menneisyys.
Hellyyden ehdot
January 3, 1999
Mulder epäilee, että pahuuden voimat ovat liikkeellä, kun odottava äiti menettää lapsensa epäilyttävissä olosuhteissa.
Sadekuningas
January 10, 1999
Kuivuuden vaivaamalta seudulta löytyy mies, joka väittää pystyvänsä yllättäviin tekoihin.
S.R. 819
January 17, 1999
Mulderilla ja Scullylla on vuorokausi aikaa pelastaa vakavasti sairastunut FBI:n apulaisjohtaja Skinner.
Tithonus
January 24, 1999
Scullyn tutkimuksen kohteena on rikoksen uhreja kamerallaan ikuistava vanha mies, joka kertoo vaistoavansa kuoleman läheisyyden.
Kaksi isää, osa 1
February 7, 1999
Avaruusolioiden kaappaama Cassandra Spender löydetään yllättäen leikkaussaliksi muunnetusta rautatievaunusta, ja käy ilmi, että hän on Mulderin ja Scullyn tutkimusten avainhenkilö.
Yksi poika, osa 2
February 14, 1999
Mulder pääsee vihdoinkin selville avaruusolentojen ja Syndikaatin välisestä salaliitosta.
Agua Mala
February 21, 1999
Salaisten kansioiden isä, eläkepäiviään Floridassa viettävä agentti Arthur Dales kutsuu Mulderin ja Scullyn paikalle, kun näyttää siltä, että paraikaa riehuva pyörremyrsky on tuonut mukanaan jotakin hyvin tavallisuudesta poikeavaa.
Maanantai
February 28, 1999
Mulder, Scully ja epätoivoinen pankkirosvo elävät painajaismaisen maanantain tapahtumat uudelleen ja yhä uudelleen.
Arcadia
March 7, 1999
Avioparina esiintyvät Mulder ja Scully muuttavat suositulle omakotialueelle kolmen mysteerisen katoamistapauksen jälkeen.
Alfa
March 28, 1999
Tohtori Ian Detweilerin Kiinasta hankkima harvinainen koira pystyy tekemään varsin epätavallisia temppuja.
Trevor
April 11, 1999
Mulder ja Scully jäljittävät vankilasta kadonnutta rikollista, jolla ilmeisesti on kyky mennä vaikka läpi harmaan kiven.
Milagro
April 18, 1999
Scully ihastuu selittämättömällä tavalla murhatutkimuksen pääepäiltyyn, Mulderin naapurissa asuvaan kirjailijaan.
Tähtipelaaja
April 25, 1999
Arthur Dalen veli kertoo avaruudesta tulleesta baseball-sankarista, joka pelasi 1940-luvulla mustien joukkueessa Roswellissa, Uudessa Meksikossa.
Kolmoset
May 2, 1999
The Lone Gunmen -ryhmän jäsenet Byers, Frohike ja Langley yrittävät lypsää sisäpiirin tietoa Las Vegasissa pidettävän konferenssin jäseniltä, kun salaperäinen hahmo monen vuoden takaa, Susanne Modeski, ilmaantuu kasinolle.
Kentällä
May 9, 1999
Mystisissä olosuhteissa kuolleen nuoren parin luurangot vievät Mulderin ja Scullyn Pohjois-Karolinaan alueelle, jonka taivaalla vuosisatojen ajan on havaittu merkillisiä valoilmiöitä.
Biogeneesi
May 16, 1999
Afrikasta löydetyt salaperäistä kirjoitusta sisältävät metalliesineet ovat Mulderin käsityksen mukaan todiste siitä, että elämä maapallolle on tuotu ulkoavaruudesta.
