Episodi
Il mondo sta cambiando
September 25, 1999
Jarod viene catturato di nuovo dal Centro e torturato da Mr. Lyle, che adesso ha i poteri dopo che Mr. Parker e Mr. Raines sono stati rimossi dal loro incarico da Big Motumbo. Jarod scopre però un complotto per uccidere una squadra di ricercatori nucleari composta da un uomo e sua moglie, e ciò gli dà una motivazione in più per scappare e salvare la famiglia in Africa. Nel frattempo, Miss Parker si riprende dopo la ferita da proiettile dopo essere stata posta in "vigilanza suicida" nell'ospedale di S. Caterina ad Oak Point da Mr. Lyle, e cerca di trovare suo padre e capire di chi fidarsi, mentre Sydney e Broots cercano di saperne di più sul "Progetto Silenzio" e di ritrovare Miss Parker. Mr. Parker scappa dal Triumvirato in Africa e va a trovare sua figlia, seguito da Mr. Raines, cha pare aver scoperto la fede. Un misterioso nuovo personaggio, Mr. White, ha delle informazioni su Emily, la sorella di Jarod.
Abisso
October 2, 1999
Jarod si unisce al Dipartimento di Indagini Criminali dell'Esercito per indagare sull'apparente suicidio di un soldato in un allenamento di sopravvivenza per prigionieri di guerra in Texas, meglio noto come la "settimana infernale". Nel frattempo, Jarod dà a Miss Parker e Mr. Lyle un assaggio di quell'allenamento rinchiudendoli insieme in un container in spedizione.
Il volo dell'angelo
October 30, 1999
Jarod si infiltra in un night-club dove un mago tiene un pericoloso culto gotico con dei giovani seguaci per ritrovare una ragazza scomparsa. Nel frattempo, Jarod invia al Centro una testa di cera senza volto per avvertire che l'ultimo arrivato, Mr. Cox, può essere il loro carnefice, e Miss Parker e gli altri cercano di far combaciare i pezzi.
Affari scabrosi
November 6, 1999
Jarod diventa un terapista sessuale per indagare sul brutale assalto subito dal suo predecessore donna. Nel frattempo, Broots cerca di farsi coraggio e rivelare i suoi sentimenti a Miss Parker.
In viaggio verso casa
November 13, 1999
Jarod si ritrova su un viaggio in strada per aiutare una giovane donna, Zoey, in fuga dal suo ex fidanzato e dal suo passato, e senza volerlo si innamora di lei. Zoey, determinata a vedere per l'ultima volta la sua amata nonna, prega Jarod di fingersi il suo fidanzato così la sua famiglia penserà che lei è in buone mani. Nel frattempo, Jarod dice a Miss Parker, Sydney e Broots di "seguire la strada dei mattoni gialli", e i tre si imbarcano in una spedizione ispirata al "Mago di Oz".
Sfida estrema
December 4, 1999
Jarod finge di essere un appassionato di sport estremi per capire cosa è successo ad un giovane che pratica bungee-jumping finito in coma. Nel frattempo, Miss Parker, Sydney e Broots seguono la serie di tracce lasciate da Jarod sulla falsariga del quiz televisivo "Facciamo un affare", e si ritrovano ad indagare su Mr. Lyle.
Violet
December 11, 1999
Jarod finge di essere uno psicologo per scoprire l'identità di Violet, una "ragazza selvaggia" trovata a vivere da sola nella foresta, e le circostanze attorno alla sua vicenda. Nel frattempo, Miss Parker scopre che un contatto del Centro è stato allontanato dalla vita di suo padre, e ciò la porta a guardare attentamente a Mr. Cox...
Terrore in ospedale
January 8, 2000
Jarod diventa un negoziatore di ostaggi per l'FBI e tratta con due fratelli che si sono impadroniti di un'ala di un ospedale con alcuni ostaggi per ottenere il denaro per l'operazione al cuore per loro padre, denaro negato dalla loro compagnia assicurativa. Nel frattempo, Miss Parker ritarda la cattura di Jarod per incontrarsi di nascosto con suo padre, che continua a nascondersi dal Centro: l'uomo le consegna la chiave di una cassaforte situata nel sottolivello SL-22, dove lei troverà il denaro per lui e Brigitte, ma la chiave non funziona. Quando l'uomo apre la cassaforte con un'altra chiave e prende il denaro, sua figlia vede una busta con la scritta "Pratiche Mediche Baby Parker", chiedendo maggiori spiegazioni al padre, che però rifiuta di parlare...
Nome in codice: Rumor
January 15, 2000
Nel primo anniversario della morte di Thomas, Jarod dà un suggerimento a Miss Parker per farle riprendere la caccia del suo assassino, il cui nome in codice è "Rumor", ma la ricerca porta a Brigitte, che è molto vicina a partorire. Brigitte dice di pentirsi di quello che ha fatto a Thomas, confessando che gli ordini sono provenuti dall'interno del Centro. Poco dopo Brigitte muore mentre sta dando alla luce il bambino, e Mr. Parker, che ha vicino Mr. Cox, confessa alla figlia di aver sposato Brigitte soltanto per il bambino.
Morte di un amico
February 5, 2000
Jarod si finge un agente del Servizio Segreto per scoprire chi ha ucciso un buon amico che anni prima lo ha aiutato a scappare dall'edificio del Centro, ma dato che la vittima era anch'egli un agente segreto l'agente dell'FBI Rachel Burke indaga sulle possibilità di omicidio, e il suo rapporto di lavoro con Jarod ha un inaspettato risvolto romantico. La task force sui crimini violenti dell'FBI, guidata da Bailey Malone, sembra però essere in rotta di collisione con Jarod quando viene scoperto un covo di serpi all'interno del Servizio Segreto. Nel frattempo, Miss Parker e Broots aiutano Sydney ad affrontare il suo passato, e scoprono uno scheletro nel suo armadio: Sydney si riunisce con Claudia Hope, una studentessa francese che il Centro gli aveva fatto credere morta in un incidente automobilistico con lui alla guida dell'auto nel 1966 per far sì che Sydney si dedicasse esclusivamente al Progetto Simulatore.
Luna di miele a Las Vegas
February 12, 2000
Jarod si trova nei guai quando viene ancora una volta chiamato a Las Vegas dal suo amico Argyle ed è costretto ad assumere l'identità di Dick Dixon, un investigatore privato con una pessima reputazione: Jarod cerca di salvare l'oggetto dell'affetto di Argyle, una showgirl di Las Vegas che ha problemi con la malavita, e intanto Benny, padre di Argyle, cerca di far ascoltare al noto cantante Wayne Newton la canzone da lui scritta, "Auf Wiedersehen", durante un torneo di beneficenza di golf. Nel frattempo, Broots è eccitato quando lui e Miss Parker sono costretti a trascorrere la notte insieme in un motel di Las Vegas mentre sono in attesa di catturare Jarod, ma le sue fantasie diventano troppo reali...
Guardia del corpo
February 19, 2000
Jarod aiuta di una donna e scopre che è un'agente in incognito che finge di essere innamorata di un venditore d'armi assassino di nome Pritchard. Dopo aver ottenuto la fiducia di Roland fingendo di essere la guardia del corpo di Jenna, Jarod scopre che la copertura di Jenna può essere compromessa da un collega un po' ambizioso, che ha messo la figlia di Jenna in custodia per assicurarsi che la donna porterà a termine il suo compito. Nel frattempo, Miss Parker grazie ad una nota di Jarod sospetta che la "conversione" religiosa di Mr. Raines non sia vera e che l'uomo possa testare una tossina letale sperimentale che il Centro aveva sviluppato negli anni 1980. Il versetto "Corinzi 15, 25" suggerito da Jarod è la chiave del Progetto nel computer di Raines, e Miss Parker, Sydney e Broots arrivano a Padre Giuseppe, un vecchio amico del liceo di Miss Parker: Giuseppe rivela loro che Raines vuole usare il gas sul piccolo Parker.
L'attentato
February 26, 2000
Jarod si infiltra in un gruppo di odio razziale per fermare dei dinamitardi che vogliono colpire durante una manifestazione. Nel frattempo, Angelo cerca di farsi strada nel passato di Jarod per trovare il vecchio nemico che al momento minaccia la vita di Jarod, e identifica l'uomo in Bartlett, leader razzista con cui Jarod e Miss Parker erano rimasti intrappolati in Florida durante un uragano.
Criminale di guerra
March 11, 2000
Jarod è un agente del Servizio di Immigrazione Nazionale e cerca di aiutare una donna cieca cambogiana a vendicare la morte della sua famiglia quando lei aveva sei anni per colpa di un colonnello criminale di guerra, Chen Ton. Miss Parler scopre in seguito che il Col. Chen Ton è anche un alleato di Mr. Lyle, e ambedue gli uomini hanno un tatuaggio di un serpente che mangia se stesso, simbolo cambogiano di cannibalismo...
Drogato
March 25, 2000
Jarod finge di essere un drogato come copertura per entrare in una clinica di recupero e aiutare una donna, Jill Arnold, che un tempo era drogata e adesso è in riabilitazione, a riottenere la custodia di suo figlio. Nel frattempo, Miss Parker e gli altri trovano il legame di Jarod con la donna tramite suo padre, David Arnold, che un tempo lavorava al Centro e aveva difeso Jarod dagli esperimenti di Mr. Raines con un narcotico sintetico che aumentava l'intelligenza, pagando il suo coraggio con la sua stessa vita.
Progetto Mirage
April 22, 2000
Jarod finge di essere un insegnante di scuola elementare per scoprire quale dei suoi precoci giovani studenti è stato anche il testimone di un omicidio... ed il prossimo bersaglio dell'assassino. Nel frattempo, Miss Parker indaga sulla recente assenza di Mr. Raines dal Centro, avvertita da una telefonata di Jarod. Broots scopre che Raines va due volte la settimana a trovare la moglie Edna, che si pensava fosse morta di overdose 20 anni prima dopo che loro figlia venne uccisa, ad un ospedale psichiatrico chiamato Pratt Institute. Sydney spiega a Miss Parker che sua madre era molto vicina ad Edna, di cui si fidava completamente. Edna fugge dall'ospedale e va a trovare Miss Parker, all'inizio scambiandola per sua madre Catherine, e le parla del "Progetto Mirage", iniziato da Catherine nella speranza che sarebbe stato compiuto dalla figlia.
Il falso antidoto
April 29, 2000
Jarod finge di essere un ladro per unirsi ad una banda di rapinatori e scoprire chi di loro ha ucciso una bambina durante la loro ultima impresa; purtroppo i piani di Jarod di scoprire l'assassino diventano una lotta contro il tempo quando lui e i suoi compagni criminali sono intrappolati in un deposito ed esposti a letali inalazioni di gas nervino, lasciando a Jarod solo sei ore per creare un antidoto salvavita. Nel frattempo, Miss Parker incontra Leonard, un impiegato del Centro che conosceva sua madre, ma l'uomo viene ucciso prima che possa parlare con lei. In seguito Miss Parker riceve una misteriosa e-mail da Edna Raines, che deve rintracciare dal computer di Mr. Raines con l'aiuto di Broots...
Segreti sepolti
May 6, 2000
Jarod compra una telecamera usata ad un banco dei pegni ed è stupito scoprendo che contiene il filmato casalingo di una ragazza e sua madre, che sono state rapite mentre si trovavano in giro in una montagna isolata. Usando le registrazioni video come unica chiave e fingendo di essere uno sceriffo, Jarod si mette in cammino per ricreare il loro viaggio e si ritrova in un piccolo paese i cui residenti affermano che gli stranieri sono maledetti dal fantasma assassino dell'"uomo del grano"... Nel frattempo, Miss Parker, Sydney e Broots, con l'aiuto di una video e-mail di Jarod, riescono a localizzare Edna Raines a Redemption Home, a New York, e corrono per salvarla prima che suo marito, Mr. Raines, la trovi per primo e la zittisca per sempre, ma arrivano troppo tardi. Miss Parker e Broots, su indicazione di Jarod, vanno a controllare la tomba di sua madre Catherine e scoprono che è vuota...
Senso interiore (Puntata doppia - 1)
May 13, 2000
Mentre Jarod progetta una fuga romantica con Zoey, riceve da suo padre, il Maggiore Charles, la splendida notizia che sua sorella Emily è stata ritrovata. Jarod corre a Philadelphia ma scopre che Emily è stata brutalmente assalita e buttata giù da una finestra da Mr. Lyle: per fortuna la ragazza viene salvata da Jarod. Indagando sull'aggressione, Jarod scopre che Emily stava seguendo un misterioso giovane di nome Ethan, che dopo il brutale assassinio dei suoi genitori adottivi progetta di mettere una bomba in un treno della metropolitana sotto il National Hotel, dove decine di emissari stranieri si stanno recando per una conferenza di pace, seguendo gli ordini diretti di Mr. Raines che lo ha plagiato. Mr. Lyle e Mr. Parker hanno un piano per ottenere il totale controllo del Centro.
Senso interiore (Puntata doppia - 2)
May 13, 2000
Mentre Jarod progetta una fuga romantica con Zoey, riceve da suo padre, il Maggiore Charles, la splendida notizia che sua sorella Emily è stata ritrovata. Jarod corre a Philadelphia ma scopre che Emily è stata brutalmente assalita e buttata giù da una finestra da Mr. Lyle: per fortuna la ragazza viene salvata da Jarod. Indagando sull'aggressione, Jarod scopre che Emily stava seguendo un misterioso giovane di nome Ethan, che dopo il brutale assassinio dei suoi genitori adottivi progetta di mettere una bomba in un treno della metropolitana sotto il National Hotel, dove decine di emissari stranieri si stanno recando per una conferenza di pace, seguendo gli ordini diretti di Mr. Raines che lo ha plagiato. Mr. Lyle e Mr. Parker hanno un piano per ottenere il totale controllo del Centro.