Episodi
Batgirl (prima parte)
September 17, 2005
Barbara Gordon racconta la storia di come è diventata Batgirl. Nella prima parte, Barbara ricorda come lei e la sua amica, Pamela Isley, hanno guidato le proteste contro le corporazioni per i danni ambientali che hanno causato, con grande dispiacere di suo padre. A sua insaputa o di Batman, Pamela è la mente dietro una serie di attacchi contro queste corporazioni con un nuovo potente supercriminale di nome Temblor. Ma presto ottiene più di quanto si aspettasse quando Temblor inizia a chiedersi perché non è stato pagato per il suo lavoro come promesso, mettendo lei e Barbara in estremo pericolo.
Batgirl (seconda parte)
September 24, 2005
Continuando la sua storia, Barbara ricorda come l'incidente chimico di Pamela durante la lotta tra Temblor e Batman, ha causato la mutazione del suo corpo e le ha dato potere su piante e spore che possono controllare la mente degli uomini. Diventata Poison Ivy, continua presto i suoi attacchi contro le corporazioni che scaricano rifiuti, ma quando rapisce il commissario Gordon e mette Batman sotto il suo controllo, Barbara, ispirata dal crociato incappucciato, diventa la sua stessa eroina sotto forma di Batgirl, l'unica in grado di cambiare le cose.
L'indimenticabile Cavaliere Nero
October 1, 2005
Bruce Wayne soffre di amnesia quando combatte contro Pinguino, dimenticando il suo ruolo di Batman e lasciandolo in grado di continuare la sua serie di crimini. Barbara, che sospetta che lui sia Batman ma in seguito crede di essersi sbagliata, cerca di fermare Pinguino ma viene presto catturata. Con Batgirl nei guai, Alfred decide che è essenziale per Bruce imparare di nuovo il suo ruolo di Batman se vuole avere qualche possibilità di essere salvata.
Burattini
October 8, 2005
Dopo essere stato nuovamente catturato, Arnold Wesker viene rilasciato da Arkham quando il dottor Hugo Strange lo "cura" rimuovendo Scarface da lui, consentendo all'ex criminale di usare il suo ventriloquio per iniziare una nuova carriera come intrattenitore per bambini. Batman inizialmente è sospettoso di ciò, ma concede ad Arnold il beneficio del dubbio, ignaro che Strange ha in programma di riunirlo al suo ex burattino, il che presto porterà guai.
L'arrivo di Gearhead
November 5, 2005
Mentre partecipa a una gara di beneficenza, Bruce vede Gearhead, un cattivo che può impossessarsi di qualsiasi cosa meccanica e trasformarla con nanomacchine in un veicolo potente e veloce, rubare il premio della gara. Sia Batman che Batgirl tentano di fermarlo, ma quando Gearhead distrugge la Batmobile, Bruce decide di costruirne una migliore che possa abbattere il cattivo.
Non solo muscoli
November 12, 2005
Batman e Batgirl si ritrovano ad affrontare nuovi guai con Joker, quando riesce a mettere le mani sul sistema di infusione di Venom di Bane per diventare una vera e propria " potenza " comica. Con la sua nuova forza, l'ultima serie di crimini di Joker sembra inarrestabile, soprattutto quando Batgirl accidentalmente fa catturare Batman quando prende in prestito la sua tuta potenziata. Per salvarlo, Batgirl scopre che deve superare i propri limiti per padroneggiare il controllo della tuta e fermare Joker.
Il sorriso del gatto
November 19, 2005
Catwoman sembra essere la sospettata del furto di un raro leopardo siberiano nero, ma si scopre presto che dietro al furto c'è Joker quando Batman e Batgirl indagano e tentano di proteggere un secondo leopardo della stessa razza, ignari che Catwoman è interessata alla questione. Quando tutti e tre scoprono che i felini sono stati rubati per Killgore Steed, il proprietario di diverse creature pericolose, nessuno si aspetta che Joker lo tradisca e usi il suo labirinto personale e le sue creature per porre fine a Batman, Batgirl e Catwoman.
Fleurs du Mal
November 26, 2005
Quando la polizia di Gotham e i funzionari governativi, tra cui il sindaco Grange e il commissario Gordon, emanano strane, nuove leggi, Barbara scopre che la causa è una misteriosa pianta che tutti hanno ricevuto. Batman e Batgirl scoprono presto che la responsabile è Poison Ivy e che ha sostituito i funzionari con copie a base vegetale, portando la coppia a fermare lei e i suoi cloni, mentre scoprono dove sono stati portati i veri funzionari.
Cash e i giocattoli
February 4, 2006
Cosmo Krank sembrava essere un ingegnoso giocattolaio, ma tutte le sue creazioni erano pericolose per i bambini, il che portò Bruce e la Wayne Industries a chiudere la sua azienda. Tuttavia, Bruce si ritrova presto nel mirino del giocattolaio, che cerca vendetta uccidendolo con nuove e diaboliche versioni dei suoi giocattoli. Sapendo che Batman deve abbatterlo, le cose non sono così facili quando il commissario Gordon assegna al detective Cash il compito di essere la guardia del corpo di Bruce finché il folle criminale non verrà arrestato, costringendo Bruce a trovare un modo per liberarsi di Cash per diventare Batman e fermare Cosmo.
L'apprendista
February 11, 2006
Arrabbiato perché Batman e la sua nuova spalla, Batgirl, stanno rovinando i suoi piani, Joker decide che ha bisogno di un apprendista tutto suo. Trova presto la persona giusta in Donnie, un burlone fuorviato che frequenta le lezioni nella stessa scuola superiore di Barbara. Quando si rende conto che Donnie è la nuova spalla di Joker chiamata Prank, lei e Batman si ritrovano a cercare di convincerlo che Joker non è un buon modello da avere.
Il tuono
February 18, 2006
Nessuno avrebbe potuto prevedere che Maximillian Zeus, un imprenditore tecnologico, miliardario e fanatico della storia greca e romana, avrebbe cercato di prendere il controllo di Gotham, ma lo fa quando sembra destinato a perdere contro il sindaco Grange durante le elezioni del sindaco. Utilizzando un aereo gigante chiamato New Olympus, equipaggiato con un'arma potente e con a bordo la sua forza di sicurezza personale di "Gladiatori", minaccia presto la città lasciando Batman a fermarlo. Ma scopre presto che Batgirl è molto più intraprendente, poiché dimostra finalmente di meritare di essere la sua spalla.
Abissi di ghiaccio
May 6, 2006
Alfred è sorpreso quando un suo vecchio compagno di scuola si presenta a Gotham e lo invita a una caccia al tesoro. Sebbene stanco del suo amico, Alfred accetta, ignaro che il tesoro cercato è l'obiettivo sia di Pinguino che di Mr. Freeze. Batman è costretto a unirsi alla caccia e presto deduce che il tesoro si trova sotto Gotham Bay.
La massima mente criminale di Gotham
May 13, 2006
Un nuovo cattivo emerge sotto forma di D.A.V.E. (Digitally Advanced Villain Emulator), un database di intelligenza artificiale creato da Hugo Strange che è codificato con le menti dei più grandi criminali di Gotham e si libera per commettere crimini. Batman si ritrova a cercare di fermare D.A.V.E., quando l'intelligenza artificiale si proclama il criminale definitivo e progetta di rivelare a Gotham la vera identità di Batman, ignaro che le cose non sono come sembrano.