Episodi
Il cuore di Lyoko
September 9, 2006
Il nuovo anno scolastico non comincia sotto i migliori auspici: grazie alla chiave di matrice XANA può ora spostarsi liberamente attraverso la rete, e i ragazzi scoprono di essere stati messi in classi diverse; inoltre, il rapporto tra Ulrich e Yumi subisce un duro colpo quando questa sostiene che tra di loro non vi potrà mai essere nulla di più di una semplice amicizia. Odd cerca di rimediare al problema delle classi separate ricattando Jim e, anche se alla fine deciderà di tornare sui propri passi pentendosi della propria condotta, riesce comunque ad ottenere ciò che voleva. Indagando su come seguire il nemico attraverso Internet, i ragazzi scoprono una stanza segreta all'interno del nucleo, in cui viene rinvenuto il Cuore di Lyoko, che XANA tenta in tutti i modi di distruggere, così da privare i suoi nemici dell'unica arma contro di lui.
Una gita da brivido
September 16, 2006
Ottenendo l'accesso ad Internet XANA è diventato ancora più potente, abbastanza da poter controllare più persone contemporaneamente, e Yumi lo scopre a proprie spese quando tutta la sua classe viene posseduta durante una gita scolastica. Mentre William e Ulrich cercano di aiutarla, su Lyoko Aelita cade a sua volta sotto il controllo di XANA per colpa dello Schyphozoa, che dopo averla soggiogata la induce a digitare il Codice XANA nella torre principale del Settore Foresta, che viene completamente cancellato.
Onda anomala
September 23, 2006
XANA lancia un nuovo attacco al mondo reale, manipolando il cibo della scuola e tramutandolo in un enorme golem; inoltre, nello stesso momento, attiva una seconda torre nel Nucleo, con cui fa sollevare il livello del Mare Digitale per impedire ad Aelita di accedere alle torri e disattivarle. Dal momento che Odd e Ulrich sono impegnati contro il mostro, Aelita e Yumi devono cavarsela da sole.
Falsi indizi
September 30, 2006
Odd perde la testa per un tamagotchi, da lui chiamato Jean Pierre (come il preside), che però una notte gli viene rubato. Nella stessa notte, XANA si infiltra nei sistemi protetti di una fabbrica di armi, provocando un attacco hacker e facendo ricadere la colpa su Jeremy. Per una serie di equivoci, i due agenti segreti inviati ad indagare sull'accaduto scambiano i ragazzi per terroristi, per poi venire posseduti da XANA e tentare di distruggere il computer. Alla fine Odd scoprirà che a far sparire Jean Pierre sono stati proprio i suoi compagni, esasperati dal suo atteggiamento.
Aelita
October 7, 2006
Aelita comincia a fare dei sogni riguardanti Franz Hopper e inizia a pensare che il padre, dopo essersi apparentemente sacrificato per riportarla in vita, potrebbe essere ancora vivo. Ne parla con Jeremy, che però considera l'ipotesi inverosimile, così assieme a Odd decide di recarsi su Lyoko da sola per controllare di persona. Un nuovo attacco di XANA al Cuore di Lyoko ritarda l'operazione, ma analizzando più tardi i dati raccolti da Aelita, Jeremy capisce che l'amica aveva ragione: Franz Hopper è vivo.
L'inganno di XANA
October 14, 2006
Johnny, il migliore amico di Hiroki, si è infatuato di Yumi, e chiede consiglio a Ulrich su come fare per conquistarla. Invece di dissuaderlo, Ulrich sceglie di divertirsi un po' alle sue spalle suggerendogli di stare sempre vicino a Yumi per attirarne l'attenzione, anche se questo finisce per creare situazioni spiacevoli tra lei e Johnny. Poco dopo, XANA lancia un nuovo attacco servendosi di uno stormo di corvi che mette Yumi in serio pericolo, ma quando gli altri si recano su Lyoko per disattivare la torre capiscono troppo tardi che si è trattato di un inganno di XANA per poter controllare nuovamente Aelita e spingerla a distruggere un altro settore: stavolta, a scomparire è il Deserto.
Il segreto
October 21, 2006
William tenta a più riprese di corteggiare Yumi, la quale però puntualmente lo respinge reputandolo un ragazzo superficiale ed inaffidabile. Una mattina però, durante l'ennesimo attacco di XANA, che tenta di far saltare in aria la fabbrica controllando un artificiere, William dà prova di grande abilità e dedizione, contribuendo in maniera decisiva a sventare l'attacco. In virtù del coraggio dimostrato da William, Jeremy, Aelita, Odd e Ulrich propongono di farlo entrare nel gruppo, ma Yumi impone il proprio veto e il Ritorno al Passato cancella ogni traccia dell'accaduto.
Un tocco di follia
November 1, 2006
Durante una missione nel Nucleo, Odd e Ulrich vengono colpiti da un nuovo attacco delle mante, in conseguenza del quale la loro percezione di Lyoko e del Mondo Reale risulta invertita. Infatti sulla Terra credono di essere su Lyoko e credono che le persone intorno a loro siano i mostri di XANA viceversa su Lyoko credono di essere sulla Terra e che i mostri di XANA siano i loro compagni e gli insegnanti di scuola. Presi per pazzi, i due ragazzi vengono rinchiusi in un ospedale psichiatrico. Fortunatamente Yumi riesce a farli uscire dall'ospedale e portarli su Lyoko seppur a fatica e con numerose difficoltà riesce a portarli in una Torre di Lyoko in cui Jeremy li libera dagli effetti dell'attacco delle mante facendoli tornare in sè per poi sventare l'ennesimo attacco di XANA.
Sabotaggio
November 2, 2006
Il supercomputer viene manomesso dal giardiniere della Kadic posseduto da XANA, e questo pregiudica le capacità di combattimento del gruppo. L'unico modo per rimettere a posto le cose è sostituire le parti danneggiate e riavviare il sistema, ma l'operazione è ostacolata dall'ispezione mensile delle stanze che costringe Jeremy a stare lontano dalla fabbrica per poter riordinare la propria. Alla fine, per riuscire a ottenere abbastanza potenza nel supercomputer e fermare allo stesso tempo un nuovo attacco di XANA, i ragazzi sono costretti a sacrificare il Settore Ghiaccio, che viene distrutto. Jeremy dice ai Guerrieri Lyoko che dovrà trovare un modo per virtualizzarli direttamente nel quinto settore, dato che resta solo il Settore Montagna.
Crisi d'identità
November 3, 2006
Jeremy sviluppa un programma in grado di materializzare i suoi compagni direttamente nel Nucleo senza bisogno di transitare da uno degli altri quattro settori, e Ulrich, i cui risultati scolastici ultimamente sono in caduta libera, viene selezionato per testarlo. Inizialmente il test sembra finire con un incidente dalle conseguenze tragiche, ma ben presto si scopre che l'esperimento ha trasformato Ulrich in una sorta di fantasma, dotandolo inoltre delle stesse capacità proprie degli spettri polimorfi. Mentre Jeremy e Aelita cercano la soluzione al problema, Ulrich decide di servirsi di queste sue momentanee capacità per possedere Jim ed evitare la bocciatura durante il consiglio scolastico.
Tre volte Odd
November 6, 2006
Odd è depresso, poiché non essendo dotato come i suoi compagni di poteri speciali il suo rendimento di guerriero risulta essere ben inferiore rispetto a quello degli altri. Per tentare di risollevargli il morale, Jeremy crea per lui il potere del Teletrasporto, ma durante il test di collaudo il programma, pur funzionando, dà vita a tre differenti cloni di Odd. Poco dopo, XANA attacca nuovamente il collegio scagliandovi contro una nube tossica capace di pietrificare chiunque tocchi, e a venirne colpito è anche uno dei tre Odd.
Un Jeremy di troppo
November 7, 2006
I ragazzi sono ormai esausti per i continui attacchi di XANA, e per ovviare alla situazione Aelita suggerisce di reclutare William come nuovo Guerriero, ma ancora una volta la proposta trova contraria Yumi. Quando però XANA attacca nuovamente, riuscendo a far distruggere ad Aelita il Settore Montagna, ancora una volta William combatte al fianco dei suoi compagni, riuscendo ad evitare l'espulsione a Yumi e vincendo così la reticenza della ragazza. William viene quindi accolto nel gruppo.
Round finale
November 8, 2006
Alla Kadic si tiene un importante torneo di skateboard a cui partecipa anche Odd; nello stesso momento Ulrich riceve la visita di suo padre, che gli impone un confronto faccia a faccia dopo l'ultima disastrosa pagella, Jeremy è bloccato con Milly e Tamia, le giornaliste della scuola, mentre Yumi è bloccata in casa dal fratello Hiroki. Così, quando XANA lancia l'attacco finale contro il Cuore di Lyoko, l'unica soluzione per Aelita è andarci con William, ma durante la missione il ragazzo viene attaccato dallo Schypozoa cadendo sotto il controllo di XANA. Nonostante l'arrivo del resto del gruppo, William riesce a distruggere il Cuore, scomparendo assieme a quanto resta di Lyoko. Stavolta sembra che XANA abbia davvero vinto, ma forse non tutto è perduto. Dai meandri della rete, infatti, un messaggio proveniente da Franz Hopper riaccende le speranze.
