Afleveringen
Terrance and Phillip in Not Without My Anus
April 1, 1998
De show begint met de opbouw van de cliffhanger van vorig seizoen die draait om Cartmans vaderlijke afkomst. Maar net als het erop lijkt dat ze verder gaan met de tweede helft van “Cartman's Mom Is A Dirty Slut”, draaien ze 180 graden om en onthullen ze dat ze voor 1 april Terrance & Phillip zullen laten zien in “Not Without My Anus”.
Cartman's Mom Is Still a Dirty Slut
April 22, 1998
Dr. Mephisto gaat onthullen wie de vader van Eric Cartman echt is! Glas versplintert en er klinken geweerschoten. Een mysterieuze aanvaller heeft blijkbaar op Mephisto geschoten terwijl de lichten uit waren. Tot groot verdriet van Eric wordt Mephisto met spoed naar het ziekenhuis gebracht. Chef rent de deur uit met Mephisto in zijn hand. Ze moeten tegen de klok vechten om Erics achtergrond te weten te komen: wie is zijn vader? Waar komt hij vandaan?
Ike's Wee Wee
May 20, 1998
Ike gaat een Briss houden en iedereen is uitgenodigd! Stan, Kenny en Cartman ontdekken wat een Briss echt is en proberen Kyle te waarschuwen dat zijn ouders Ike's plasje gaan afknippen. Kyle stuurt Ike weg om hem te beschermen tegen zijn schaarzwaaiende ouders.
Chickenlover
May 27, 1998
De Booktastic-bus is in de stad en al snel komt iedereen erachter dat agent Barbrady niet kan lezen. Hij wordt met de jongens mee naar school genomen zodat hij zijn baan kan redden. Terwijl hij daar is, heeft iemand in South Park seks met de kippen van de stad en alleen agent Barbrady en zijn nieuwe hulpsheriffs Kenny, Kyle, Stan en Cartman kunnen hen tegenhouden!
Conjoined Fetus Lady
June 3, 1998
Kyle is gewond en moet naar de schoolverpleegster. Hij is doodsbang vanwege de verhalen die hij heeft gehoord. Ze ziet er vrij normaal uit, behalve de dode foetus die uit haar hoofd steekt. Kyle's moeder onderwijst de jongens over haar “aandoening” en besluit dat iedereen in South Park op de hoogte moet worden gebracht. Ondertussen gaat het South Park Cows trefbalteam naar de staats-, nationale en uiteindelijk internationale finales in China.
The Mexican Staring Frog of Southern Sri Lanka
June 10, 1998
Mr. Garrison geeft de jongens de opdracht om over Vietnam te leren van iemand die ze kennen. Stan's oom Jimbo en zijn vriend Ned vertellen de jongens hun schandalige verhaal. Meneer Garrison gelooft het verslag van de jongens niet en laat ze nablijven. Ze beramen wraak op Stan's oom door hen een nepvideo van de Mexicaanse Staringkikker van Zuid-Sri Lanka voor te leggen.
City on the Edge of Forever (Flashbacks)
June 17, 1998
Terwijl hun schoolbus aan de rand van een klif bungelt, herinneren de jongens zich enkele van hun vroegere avonturen. Mrs. Crabtree gaat met een vreemde mee naar de stad en wordt een korte tijd standup comédienne. Terug in South Park overtuigt Mr. Mackey de ouders ervan dat hun vermiste kinderen moeten zijn weggelopen. Uiteindelijk is het allemaal een droom in een droom.
Summer Sucks
June 24, 1998
De scholen zijn uit voor de zomer en nu meneer Hat vermist is, is meneer Garrison over de rooie. De staat heeft een verbod op de verkoop van vuurwerk en dat verpest de plannen van de jongen voor de viering van 4 juli. Mr. Garrison zoekt psychiatrische hulp bij Dr. Katz terwijl Jimbo en Ned naar Mexico gaan in een poging vuurwerk terug te smokkelen naar de kinderen van Amerika.
Chef's Chocolate Salty Balls
August 19, 1998
Een filmfestival verhuist naar South Park, maar heeft een verwoestend effect op de riolering. Mr. Hankey roept Kyle om hulp. De filmmensen interpreteren Kyle's smeekbede als een verkooppraatje en ze maken van zijn verhaal al snel een film met Tom Hanks en een aap die ze “Mr. Hankey” noemen. Kyle is woedend dat de filmmakers niet naar zijn pleidooi luisteren. Al snel geeft Chef's Salty Chocolate Balls iedereen energie.
Chickenpox
August 26, 1998
Cartmans moeder probeert de jongens de waterpokken te bezorgen door ze naar Kenny te sturen voor een logeerpartijtje. Zowel Stan als Cartman breken uit, maar Kyle blijft immuun. Kyle ontdekt “de ouderlijke samenzwering” en huurt samen met de andere jongens een prostituee in om hun ouders herpes te geven. Ondertussen herenigen Kenny's moeder en Kyle's moeder hun echtgenoten die beiden jeugdvrienden waren die uit elkaar groeiden.
Roger Ebert Should Lay Off the Fatty Foods
September 2, 1998
De kinderen gaan op excursie naar het planetarium. Alle kinderen behalve Cartman doen vreemd. Zoals gewoonlijk proberen Stan en Kyle, met Kenny's opoffering, het mysterie tot op de bodem uit te zoeken. Ondertussen wint Cartman een optreden in een snackreclame. De vier jongens komen tot de kern van het vreemde planetarium.
Clubhouses
September 23, 1998
Stan moet een clubhuis bouwen zodat hij en Kyle “Truth or Dare” kunnen spelen met Wendy en haar vriendin, die verliefd is op Kyle. Cartman en Kenny nemen wraak door zelf een clubhuis te bouwen; alleen die van hen hebben lekkere meiden. Ondertussen loopt het huwelijk tussen de Marshes op de klippen en leert Stan een waardevolle les over liefde en familie.
Cow Days
September 30, 1998
Het jaarlijkse “Cow Days” feest in South Park is begonnen! De koeien zijn gefixeerd op een koeienbeeld. Om aan het geld te komen dat ze nodig hebben om Terrance en Phillip te winnen, schrijven de jongens Cartman in voor een wedstrijd stier rijden. Door een bizar ongeluk denkt Cartman dat hij een Vietnamese prostituee is met de naam Ming Li. De jongens leren over geld en koe-gekte.
Chef Aid
October 7, 1998
Chef wordt aangeklaagd door Capitalist Records omdat hij probeert de rechten te krijgen van een nummer dat hij twintig jaar geleden heeft geschreven. Hij heeft 2 miljoen dollar nodig om Johnny Cochran in te huren. De jongens verzamelen alle oude muzikantenvrienden van Chef en organiseren een groot concert om het geld bij elkaar te krijgen.
Spookyfish
October 28, 1998
Sharon Marsh's tante Flo brengt haar maandelijkse bezoek en ze heeft een cadeau voor Stan, een vis. Stan's vis maakt hem helemaal gek, vooral wanneer de lijken zich beginnen op te stapelen. Mevrouw Marsh is ervan overtuigd dat Stan de moorden pleegt en begint de lichamen te verbergen. De jongens ontdekken dat er twee Cartmans zijn en een poort naar een parallel universum in de “Indian Burial Ground Pet Store.
Merry Christmas Charlie Manson!
December 9, 1998
Kyle, Stan en Kenny vergezellen Eric en zijn familie naar een kerstfeest met de familie Cartman. Eén van Cartmans familieleden breekt uit de gevangenis voor de reünie, samen met zijn celmaat, Charles Manson.
Gnomes
December 16, 1998
Harbucks coffee is van plan om zich in South Park te vestigen en Tweek coffee shop te sluiten. Meneer Garrison geeft opdracht voor een verslag over actuele gebeurtenissen om hem te helpen zijn baan te behouden. De jongens willen hun verslag maken over de onderbroekenkabouters. De vader van Tweek wil het verslag van de jongens gebruiken om Harbucks te bestrijden. Het rapport dat de jongens afleveren zet de stad aan tot actie.
Prehistoric Ice Man
January 20, 1999
Kyle valt in een grot. Stan gaat hem redden en vindt een ijsman, en de twee vechten met elkaar om de enige eer. Dr. Mephisto ontdekt dat de ijsman al sinds 1996 bevroren is. De ijsman wordt tentoongesteld en de vechtende Kyle en Stan bevrijden hem. De ijsman probeert terug te keren naar zijn familie, maar ontdekt dat hij een man buiten de tijd is. Ondertussen heeft de regering haar eigen plannen om de ijsman te gebruiken in hun complot tegen Zweden.