Odcinki
Oblężenie (3)
July 15, 2005
Dedal przybywa, by bronić Atlantydy przed atakiem Wraith, ale może to nie wystarczyć, gdy zespół odkryje, że zbliża się jeszcze większa armada.
Intruz
July 22, 2005
Dedal jest zainfekowany wirusem komputerowym Wraith, podczas gdy członkowie ekspedycji mają nadzieję powrócić na Ziemię.
Uciekinier
July 29, 2005
Sheppard i jego zespół próbują zlokalizować porucznika Forda, aby znaleźć się w niewoli byłego żołnierza ściganego przez Wraith.
Duet
August 5, 2005
Wejście z Wraith Dart pozostawia świadomość przedwcześnie żyjącego oficera bezpieczeństwa Atlantydy uwięzionego w umyśle doktora McKaya.
Skazany
August 12, 2005
Zespół Atlantis znajduje kulturę, która żyje w względnym bezpieczeństwie od Wraith, ponieważ przekazują swoich przestępców do Wraith - i lądują w niestabilnej kolonii karnej.
Trójca
August 19, 2005
McKay naraża zespół na próbę udoskonalenia niedokończonej starożytnej technologii, która zniszczyła cywilizację. Ronon Dex odkrywa, że nie jest samotnym ocalałym ze swojego świata.
Instynkt
August 26, 2005
Zespół odkrywa młodą dziewczynę Wraith, która została wychowana przez człowieka i ukrywa się przed ludźmi z jej ludzkiej wioski w obawie przed jej życiem.
Konwersja
September 9, 2005
Pułkownik Sheppard zaczyna doświadczać niepokojącej fizycznej transformacji po tym, jak został wystawiony na działanie leku anty-Wraith Becketta.
Aurora
September 23, 2005
Kiedy zespół odnajduje dryfujący na skraju galaktyki Starożytnego okrętu wojennego, jego ekipa wciąż żyje, pułkownik Sheppard wchodzi do wirtualnej rzeczywistości, aby się z nimi komunikować.
Zaginieni chłopcy (1)
September 23, 2005
Zespół zostaje schwytany przez brak porucznika Forda, który prowadzi teraz grupę młodych mężczyzn którzy biorą enzym Wraith - i którzy chcą pomocy zespołu w ataku samobójczym na statek Wraith.
Ul (2)
November 16, 2005
Pułkownik Sheppard i jego zespół znajdują się w więzieniu Wraith po ataku Forda na statek Wraith. Dr McKay dokłada wszelkich starań, aby im pomóc.
Olśnienie
November 28, 2005
Sheppard znajduje się na planecie, gdzie czas płynie szybciej, bez możliwości skontaktowania się ze swoją drużyną lub powrotu na Atlantis.
Masa Krytyczna
December 5, 2005
Kiedy agent Trustu zasadzi bombę na Atlantydzie, zespół musi znaleźć szpiega w swoich szeregach, zanim przyjdą Wraith i odkryją miasto.
Łaska pod presją
December 10, 2005
Kiedy doktor McKay zostaje uwięziony pod wodą w zatapialnym skoczku, jego jedyna szansa na przeżycie może być halucynacją Samanthy Carter.
Wieża
December 19, 2005
Zespół znajduje świat, który posiada starożytną technologię obronną, gdzie pułkownik Sheppard staje się pionkiem w rywalizacji między spadkobiercami na tron.
Długie pożegnanie
January 2, 2006
Zespół odkrywa dwie kapsuły zawierające umysły obcych istot, które przejmują kontrolę nad ciałami Weir i Shepparda, aby kontynuować ich osobistą wojnę.
Zamach stanu
January 9, 2006
Po zniknięciu drużyny z Atlantis wyprawa znajduje się w samym sercu zamachu stanu Genii.
Michael
January 16, 2006
Młody Amnezjanin w Atlantydzie cierpi z powodu niepokojących koszmarów, że jest Wraith, tylko po to, by dokonać szokującego odkrycia na swój temat.
Piekło
January 23, 2006
Zespół Shepparda spotyka cywilizację, która ma zostać zniszczona przez super-wulkan i zostaje uwięziona tam, gdy Gwiezdne Wrota zostaną zniszczone podczas ewakuacji.
Sojusznicy (1)
January 30, 2006
Michael i jego frakcja Wraith przybywają do Atlantydy, by zaproponować sojusz, mając nadzieję na wykorzystanie retrowirusa do przekształcenia swoich wrogów Wraith w ofiary.