Odcinki
Dryf (2)
September 27, 2007
Unosząc się w kosmosie, gdy miasto traci tarcze ochronne, zespół musi zrobić wszystko, aby utrzymać Atlantis przy życiu. Radykalne obrażenia zagrażają życiu Dr. Weir
Linia życia (3)
October 4, 2007
Pułkownik Sheppard i jego zespół podejmują ryzykowną misję kradzieży Z.P.M. od replikatorów - ale musi polegać na Dr. Weir, aby odnieść sukces.
Zjazd
October 11, 2007
Kiedy grupa ludzi Ronona pozyskuje pomoc zespołu w napadzie na obiekt z bronią Wraith, Ronon zastanawia się, czy jego przyszłość leży w Atlantydzie, czy w jego przyjaciołach.
Doppelganger
October 18, 2007
Podczas misji poza światem pułkownik Sheppard nieświadomie staje się gospodarzem obcego bytu, który zaraża innych na Atlantydzie i nęka ich przerażającymi koszmarami.
Podróżnicy
October 25, 2007
Pułkownik Sheppard zostaje schwytany przez mieszkańców generacyjnego statku i ich pięknego przywódcę, który chce wykorzystać swoją umiejętność wykorzystania starożytnej technologii dla własnych celów.
Tabula Rasa
November 1, 2007
Kiedy wirus wywołuje amnezję u wszystkich oprócz Teyli i Ronona, zespół Atlantis musi współpracować, aby znaleźć lekarstwo, zanim ich wspomnienia całkowicie znikną.
Zaginiony
November 8, 2007
Podczas wizyty w Nowym Athos, Teyla i dr Keller uciekają od prymitywnego plemienia wojowników.
Widzący
November 15, 2007
Zespół spotyka człowieka o niezwykłych zdolnościach prorockich, który daje mroczne prognozy dotyczące przyszłości Atlantydy. Wraith dążą do nowego sojuszu z Atlantis podczas wojny z Replikatorami.
Przeprawa Millera
November 29, 2007
Rodney McKay wyrusza na poszukiwanie swojej siostry na Ziemi po tym, jak zostanie porwana przez szefa potężnej korporacji.
Ta śmiertelna cewka (1)
December 6, 2007
Tajemniczy dron rozbił się na Atlantydzie, wskazując, że Replikatory mogli znaleźć miasto. Ale kiedy pojawia się Elizabeth Weir, zespół zdaje sobie sprawę, że sonda jest tylko częścią większej tajemnicy.
Pamiętaj o wszystkich moich grzechach (2)
January 3, 2008
Mając plan potencjalnego wyeliminowania zagrożenia Replikatorów, zespół Atlantis musi szukać sojuszu z flotą statków Widm.
Łupy wojenne
January 10, 2008
Zespół odnajduje swój dawny statek sojusznika Wraith dryfujący w przestrzeni kosmicznej, który prowadzi ich do tajnego projektu, który może odwrócić bieg wojny domowej.
Kwarantanna
January 17, 2008
Zautomatyzowane blokowanie zatrzymuje personel Atlantis w różnych częściach miasta, mając nadzieję, że inni przyjdą im z pomocą.
Harmonia
January 24, 2008
Pułkownik Sheppard i dr McKay muszą chronić dziecięcą księżniczkę podczas pielgrzymki, zanim ona może zostać królową i dowiedzieć się, że ma niebezpiecznych wrogów, zagrażających jej życiu.
Wyrzutek
January 31, 2008
Podczas osobistego urlopu na Ziemi Sheppard i Ronon dowiadują się, że naukowcy opracowali replikator postaci ludzkiej, który jest teraz na wolności.
Trio
February 7, 2008
McKay, Carter i Keller są uwięzieni w podziemnej komnacie podczas misji poza światem, bez widocznych dróg ucieczki.
Midway
February 14, 2008
Teal'c odwiedza Atlantis, aby poradzić sobie z upartym Rononem, który jest sprawdzany przez I.O.A. Obydwaj muszą działać razem, gdy Wraith najeżdżają na stację kosmiczną Midway, aby dotrzeć do Ziemi.
Pokrewieństwo (1)
February 21, 2008
Gdy tajemnicza nowa choroba przechodzi przez galaktykę Pegaza, Teyla jest przekonana wizją, że ojciec jej dziecka próbuje się z nią komunikować.
Pokrewieństwo (2)
February 28, 2008
Zespół jest zszokowany, gdy stary przyjaciel, którego uważano za zmarłego, w cudowny sposób do nich wraca. Teyla planuje ucieczkę z niewoli Michaela.
Ostatni człowiek (1)
March 6, 2008
Sheppard wraca do Atlantydy po misji i znajduje opuszczone miasto, wszystkie systemy są martwe - i zamiast oceanu, wydmy piaszczyste aż okiem sięgają.