Temporada 3
October 1, 2003
A terceira temporada segue a luta constante de Clark contra o destino que seu pai biológico, Jor-El, tem para ele, e sua culpa em relação ao preço pago de Jonathan para trazê-lo de volta para Smallville. Lex começa a ser visto como um psicopata desde quando ele tinha ido parar em uma ilha deserta, enquanto o conflito entre ele, seu pai, Lionel Luthor e sua amiga Chloe Sullivan chega a um golpe final. O segredo de Clark começa a pesar sobre Pete, e o relacionamento entre Clark e Lana chega num beco sem saída. Os roteiristas também trouxeram vários personagens da DC Comics, como Maggie Sawyer, Morgan Edge, e mais notadamente Perry White, em participações especiais.
22 Episódios
Episódios
Exílio
October 1, 2003
Sob a influência da Kryptonita vermelha e vivendo em Metrópolis, Clark se envolve com o rei do crime Morgan Edge, que o contrata para invadir a Luthor Corp.
Fênix
October 8, 2003
Clark e seu pai Jonathan lutam, até Clark decidir voltar a Smallville sem o anel de Kryptonita Vermelha.
Extinção
October 15, 2003
Van McNulty, aluno do Colégio Smallville, rouba informações confidenciais de Chloe e passa a matar todos os infectados e suspeitos de serem infectados por meteoro.
Adormecido
October 22, 2003
Clark sonha constantemente com Sarah pedindo sua ajuda e logo ele descobre que ela é sua nova vizinha que se encontra em coma.
O Repórter
October 29, 2003
Perry White vê Clark usar seu poder e elabora um plano para que ele revele sua verdadeira identidade.
Relíquia
November 5, 2003
Clark descobre que seu pai biológico, Jor-El, já esteve na terra mais ou menos 40 anos atrás. O tio-avô de Lana fornece fotos do passado, deixando Clark perplexo.
Magnetismo
November 12, 2003
Lana muda de comportamento, se tornando uma mulher perigosa após se envolver com um rapaz. Só que esse novo namorado de Lana possui poderes, e as atitudes da moça se devem a eles.
Surto
November 19, 2003
Morgan Edge volta a Smallville e Lex tenta forçá-lo a contar a verdade sobre a morte dos pais de Lionel.
Sanatório
January 14, 2004
Três pacientes do sanatório se unem para fugirem, o primeiro é Eric Summers que conseguiu transferir os poderes de Clark para si.
Sussurro
January 21, 2004
Clark fica cego quando ele usa sua visão de calor para destruir uma bijuteria feita de kryptonita, mas o raio acaba sendo refletido, causando cegueira nele.
Apagado
January 28, 2004
Chloe sofre atentados por parte de Lana e Clark. Sem saber o porquê disso, Clark pede ajuda a Lex para resolver essa história e descobrir quem esta tentando matar Chloe.
No outro mundo
February 4, 2004
Jordan prevê o futuro e diz a Clark que Lana irá morrer, Clark corre contra o tempo para mudar o destino de Lana.
Velocidade
February 11, 2004
Pete é ameaçado por ladrões de um racha após vacilar, e sem saber o que fazer, ele suplica para que Clark o ajude.
Obsessão
February 18, 2004
Clark conhece Alicia, uma infectada por meteoros. Sentindo-se livre perto da moça, eles se envolvem em uma relação.
Ressurreição
February 25, 2004
Garrett tem seu irmão morto por causa de uma enfermidade no fígado. Só que inacreditavelmente ele volta vivo no outro dia após já ter entrado em óbito.
Crise
March 3, 2004
Clark recebe um misterioso telefonema de Lana, só que a ligação veio do futuro e nela, Lana é baleada por Adam Knight.
Legado
April 14, 2004
Jonathan começa a agir de forma diferente e Clark acha que isso tem a ver com Jor-El e por isso vai para as cavernas tirar satisfações com ele, só que ele é flagrado por Lionel lá.
Verdade
April 21, 2004
Chloe em busca de vingança por seu pai ter sido demitido injustamente, vai investigar a LuthorCorp e acaba sem querer sendo infectada.
Lembranças
April 28, 2004
Acreditando que a informação chave sobre o passado de seu pai foi perdida quando sua memória foi apagada, Lex decide se juntar a um programa experimental com o Dr. Garner.
Talismã
May 5, 2004
Jeremiah Holdsclaw, um jovem índio Kiwatche, rouba uma faca mística das cavernas tribais e obtém superpoderes semelhantes aos de Clark.
Renúncias
May 12, 2004
Emily, antiga amiga de Lana que morreu e foi clonada na Luthorcorp foge e vai em busca de Lana. Ela a prende e mente a Clark que Lana já foi pra Paris.
O Acordo
May 19, 2004
Kara aparece na vida de Clark pedindo para que ele cumpra seu destino. Enquanto isso, o julgamento de Lionel acontece e Lex e Chloe conseguem colocá-lo atrás das grades.
