Эпизоды
Начало
November 8, 1998
ФБР восстанавливает отдел "Секретные материалы", однако отстраняет от работы в нем агентов Малдера и Скалли и передает дела специальным агентам Спендеру и Фоули. Тем временем Курильщик использует телепатические способности похищенного Синдикатом вундеркинда Гибсона для поимки инопланетного существа.
Гонка
November 15, 1998
Агент Малдер оказывается в одной машине с вооруженным преступником Патриком Крампом, который приказывает ему вести машину по пустыне Невады в западном направлении на высокой скорости, ни в коем случае не останавливаясь. Остановка или снижение скорости причиняет Крампу страшные головные боли.
Треугольник
November 22, 1998
Отправившись в Бермудский треугольник на поиски исчезнувшего во время Второй мировой войны круизного лайнера, агент Малдер попадает в зону временной аномалии и оказывается в 1939 году на захваченном нацистами корабле.
Зазеркалье
November 29, 1998
При попытке проникнуть в зону 51, Малдер и Скалли становятся свидетелями полета секретного летательного аппарата. Из-за созданной аппаратом временно-пространственной аномалии агент Малдер меняется телами с Моррисом Флетчером - человеком из службы безопасности зоны 51. Пока Малдер пытается выбраться с закрытой территории, Флетчер в его теле занимается вычислением источника утечки информации.
Зазеркалье II
December 6, 1998
Малдер, находящийся в теле Флетчера, обвиняется руководством зоны 51 в разглашении секретной информации о военных экспериментах. Тем временем, Скалли начинает подозревать, что ее напарник - не тот, за кого себя выдает.
Как призраки похитили Рождество
December 13, 1998
В канун Рождества Малдер привозит Скалли в заброшенный особняк в Мэриленде. По его словам, этот дом населен призраками. Скептически настроенная Скалли вскоре вынуждена поменять своё мнение, лицом к лицу столкнувшись с духами давно погибших влюбленных.
Язык нежности
January 3, 1999
Агент Спендер отвергает дело о предполагаемом похищении нерожденного ребенка демоном в Роаноке, штат Виргиния. За дело берется агент Малдер, который в ходе расследования сталкивается с демонической сущностью отца погибшего малыша.
Король дождя
January 10, 1999
Малдер и Скалли отправляются в город Кронер, штат Канзас, расследовать аномальные погодные явления. Они выясняют, что погода в городе тесно связана с эмоциональным фоном одного из местных жителей.
Резолюция Сената № 819
January 17, 1999
Замдиректора ФБР Уолтер Скиннер заражен неизвестной науке смертельной болезнью. У Малдера и Скалли есть 24 часа, чтобы найти лекарство и спасти своего бывшего начальника.
Титон
January 24, 1999
Замдиректора Кёрш дает Скалли шанс вернуться к расследованиям значимых дел, разлучив ее с агентом Малдером. Скалли отправляется в Нью-Йорк, чтобы разобраться в сверхъестественной способности местного фотографа прибывать на место преступления как раз вовремя, чтобы заснять последние мгновения жизни умирающих людей.
Два отца
February 7, 1999
С возвращением Кассандры Спендер близится начало запланированной колонизации Земли пришельцами. Членам Синдиката предстоит определиться с судьбоносным выбором стороны в битве колонистов и повстанцев, а агентам Малдеру и Спендеру - узнать страшную правду о своем прошлом.
Один сын
February 14, 1999
Синдикат достигает апогея в своих планах и сталкивается со своей судьбой. Малдер и Скалли пытаются спасти Кассандру Спендер от предназначенной ей роли в грядущем вторжении инопланетян.
Плохая вода
February 21, 1999
Вернувшиеся к "Секретным материалам" Малдер и Скалли отзываются на просьбу бывшего агента ФБР Дэйлса и отправляются в город Бэдлэнд, штат Флорида, оказавшийся во власти урагана. Им предстоит столкнуться с неизвестным науке хищным организмом, обитающим в воде.
Понедельник
February 28, 1999
Малдер и Скалли оказываются в ловушке временной петли, снова и снова переживая события одного и того же дня, в котором они оба погибают от взрыва бомбы во время ограбления банка.
Аркадия
March 7, 1999
В калифорнийском городке Аркадия бесследно пропадают жители. В интересах расследования Малдер и Скалли под видом супружеской пары заселяются в городок и вскоре выясняют, что странная любовь местных жителей к строгому распорядку обусловлена страхом перед неизвестным монстром.
Альфа
March 28, 1999
В порту Лос-Анджелеса с грузового судна сбегает редкий красный волк из Азии, убив двух грузчиков. Дикое животное принимается убивать людей, проявляя при этом вполне человеческий интеллект. Малдер обращается к специалисту по волкам - своей подруге по переписке для помощи в расследовании.
Тревор
April 11, 1999
Из тюрьмы Стрингер, штат Миссисипи, при странных обстоятельствах сбегает заключенный. При попытке его задержания агенты Малдер и Скалли обнаруживают, что он имеет аномальную способность проходить сквозь твердые электропроводящие предметы.
Чудо
April 18, 1999
Скалли заводит случайное знакомство с новым соседом Малдера - молодым писателем Филиппом, к которому начинает испытывать загадочное влечение. Выясняется, что книга, которую пишет Филипп, связана с происходящими в Вашингтоне убийствами, где сердца жертв словно вынимают из грудных клеток без видимых внешних повреждений.
Неестественный
April 25, 1999
Бывший полицейский Артур Дейлс рассказывает агенту Малдеру историю чернокожего бейсболиста из Розуэлла, который на самом деле оказался инопланетянином, влюбленным в спорт землян.
Триплет
May 2, 1999
Одинокие Стрелки убеждают агента Скалли помочь им решить проблему их старой знакомой Сьюзан Модески, жених которой занимается разработкой мощного психотропного препарата для совершения политических убийств.
Полевой выезд
May 9, 1999
Малдер и Скалли отправляются в леса Северной Каролины расследовать загадочную гибель семейной пары, от которой за несколько дней остались только лишенные плоти кости. Во время расследования агенты обнаруживают гигантскую колонию галлюциногенных плотоядных грибов.
Биогенез
May 16, 1999
В Кот-д’Ивуар найден артефакт предположительно неземного происхождения, с написанными на нем символами языка навахо. Агент Скалли обнаруживает, что в артефакте зашифрована информация о происхождении человечества. В это время Малдер испытывает резкое ухудшение психического здоровья и обращается за помощью к агенту Фоули.
